Идентификация бактерий

Для начальной идентификации бактерий все, что широко используется — крашение за Граммом, которое сразу разделяет бактерии на две большие группы и отличает их от эукариотов. Некоторые организмы лучше всего идентифицируются с помощью других методов крашения, например, кислотоустойчивые бактерии (Mycobacteria, Nocardia) лучше всего идентифицируются с помощью крашения за Зелий-Нельсеном или подобных методик. Другие организмы может быть нужно идентифицировать с помощью возделывания их в специальной среде, или другими, например, серологическими методами.

Методы культур позволяют рост только определенного вида или группы бактерий, ограничивая рост других бактерий в образце. Часто эти методы разрабатываются для специфических образцов, например, образец слюны будет рассматриваться для идентификации организмов, которые вызывают пневмонию, а образец кала будет рассматриваться для идентификации организмов, которые вызывают пронос, предотвращая росту неболезнетворных бактерий. Образцы, которые по обыкновению стерильные, например, кровь, моча или спинная жидкость, культивируются при условиях, созданных, чтобы вырастить все возможные организмы. Как только болезнетворный организм будет изолирован, он может быть охарактеризован крашением, за своей морфологию и метаболизмом (например, аэроб или анаэроб) и гемолитичными свойствами. Как с классификацией бактерий, для отождествления бактерий все больше используются молекулярные методы. Диагностика с помощью таких, основанных на ДНК, методов, например, полимеразной цепной реакции, наращивая популярность благодаря ее специфичности и скорости, сравнительно с методами, основанными на культуре.