Происхождение бактерий

Предки современных бактерий были одноклеточными микроорганизмами, которые были одними из первых форм жизни, которая распространилась на Земле около 4 млрд. лет тому. На протяжении близко 3 млрд. лет все организмы были микроскопическими и бактерии и археи были доминирующими формами жизни. Хотя и существуют бактериальные окаменелости, например, строматолиты, отсутствие в них отличительной морфологии препятствует их использованию для получения данных относительно прошлой истории бактериальной эволюции или датирования времени происхождение специфических видов бактерий. Однако, генетические последовательности (в так называемой молекулярной филогенетике) могут использоваться для восстановления бактериального филогенеза, и их данные указывают, что бактерии первыми отклонились от линии архей/эукариотов. Последний общих предок бактерий и архей был вероятно термофилом, который жил 2,5-3,2 млрд. лет тому, хотя возможно, что через высокий уровень горизонтального переноса генов в тот период нужно говорить не об одном общего предка, а о популяции.

Бактерии также приняли участие во второму большом эволюционном пороге между археями и эукариотами. Эукариоты появились, когда древние бактерии вступили в эндосимбиотичные ассоциации с предками эукариотов. Этот процесс включал увлечение древних альфа-протеобактерий, формируя митохондрии, и древних цианобактерий, формируя хлоропласты.